* Alkemi sågs ofta som en form av magi. Under medeltiden ansågs magi vara en kättersk utövning, och alla som greps för att utöva den kunde straffas hårt. Som ett resultat höll många alkemister sitt arbete hemligt för att undvika att bli förföljda.
* Alkemister var ofta mycket hemlighetsfulla om sitt arbete eftersom de fruktade att andra skulle stjäla deras hemligheter. Alkemi var ett mycket konkurrensutsatt område, och många alkemister trodde att deras arbete var av stort värde. Som ett resultat var de ofta mycket ovilliga att dela sina hemligheter med andra.
* Vissa alkemister var helt enkelt galna. Alkemi var en process som ofta var en trial-and-error-process, och många alkemister tillbringade år eller till och med årtionden med att arbeta på experiment som i slutändan aldrig skulle bli någonting. Som ett resultat blev vissa alkemister helt enkelt galna. I dessa fall kan deras sekretess ha berott på enkel excentricitet.
Oavsett orsaken bidrog det faktum att alkemin praktiserades i hemlighet till dess mystiska och fascinerande rykte.