A vida de Junipero Serra começou na ilha mediterrânea de Maiorca como Miguel José Serra y Ferrer. Pouco se sabe sobre seus primeiros anos, exceto que foram marcados por doenças. Sua saúde debilitada, no entanto, não o impediu. Serra cresceu num ambiente religioso e desde cedo demonstrou uma profunda espiritualidade. Porém, é importante notar que detalhes sobre sua adolescência permanecem em grande parte não documentados. Sua família vivia de forma simples, o que contribuiu para o desenvolvimento da natureza humilde e compassiva de Serra.