Teoria „sfałszowanych dowodów”: Teoria ta sugeruje, że reżim Marcosa manipulował dowodami kryminalistycznymi na miejscu zabójstwa Aquino, aby zmanipulować wynik śledztwa. Krytycy zarzucają rządowi zmianę zeznań świadków, sfabrykowanie dokumentów i wprowadzenie opinii publicznej w błąd, aby oczyścić się z odpowiedzialności za śmierć Aquino.
Zaangażowanie sił rządowych: Niektórzy uważają, że w zabójstwo Aquino bezpośrednio zaangażowane były elementy filipińskiej armii lub sił rządowych. Teoria ta głosi, że reżim Marcosa zaaranżował uderzenie w Aquino, aby wyeliminować potencjalnego rywala politycznego i stłumić sprzeciw wobec rządów autorytarnych.
Tuszowanie przez urzędników wysokiego szczebla: Teoria ta głosi, że wysocy urzędnicy w rządzie Marcosa ułatwili zatuszowanie prawdziwych okoliczności śmierci Aquino. Krytycy sugerują, że wpływowe jednostki w reżimie chroniły sprawców i ukrywały istotne informacje, aby utrzymać władzę.
Zaangażowanie podmiotów zagranicznych: Podniesiono również spiski dotyczące możliwego zaangażowania podmiotów zagranicznych w zabójstwo Aquino. Teorie te często dotyczą krajów takich jak Stany Zjednoczone lub inne zagraniczne mocarstwa zainteresowane utrzymaniem swoich wpływów na Filipinach. Niektórzy spekulanci uważają, że elementy międzynarodowe mogły spiskować z reżimem Marcosa w celu usunięcia Aquino jako zagrożenia dla ich interesów.
Teoria „kozła ofiarnego”: Inny spisek sugeruje, że rząd wyznaczył określone osoby jako kozły ofiarne, które ponoszą odpowiedzialność za śmierć Aquino. Krytycy twierdzą, że niewinni ludzie zostali wrobieni i niesłusznie skazani, co chroniło prawdziwych twórców zamachu.
Warto zauważyć, że te teorie spiskowe nie zostały ostatecznie udowodnione i wielu uważa, że śledztwo w sprawie śmierci Aquino zawierało kilka nieprawidłowości. Oficjalna konkluzja Sądu Najwyższego Filipin z 2010 r. stwierdziła, że za zbrodnię odpowiedzialni byli wojsko, ale nie wskazano wyraźnie, że w zbrodnię zamieszano ówczesnego prezydenta Ferdynanda Marcosa ani jego żonę Imeldę.