* Alkymi ble ofte sett på som en form for magi. I middelalderen ble magi ansett for å være en kjettersk praksis, og alle som ble tatt i å praktisere den kunne bli straffet hardt. Som et resultat holdt mange alkymister arbeidet sitt hemmelig for å unngå å bli forfulgt.
* Alkymister var ofte veldig hemmelighetsfulle om arbeidet sitt fordi de fryktet at andre ville stjele hemmelighetene deres. Alkymi var et sterkt konkurransefelt, og mange alkymister mente at arbeidet deres var av stor verdi. Som et resultat var de ofte svært motvillige til å dele hemmelighetene sine med andre.
* Noen alkymister var rett og slett gale. Alkymi var en ofte en prøving-og-feil-prosess, og mange alkymister brukte år eller tiår på å jobbe med eksperimenter som til slutt aldri ville bli noe. Som et resultat ble noen alkymister rett og slett gale. I disse tilfellene kan deres hemmelighold ha vært på grunn av enkel eksentrisitet.
Uansett årsak, bidro det faktum at alkymi ble praktisert i det skjulte til dets mystiske og fascinerende rykte.