* Alchemie werd vaak gezien als een vorm van magie. Tijdens de Middeleeuwen werd magie beschouwd als een ketterse praktijk, en iedereen die betrapt werd op het beoefenen ervan kon zwaar gestraft worden. Als gevolg hiervan hielden veel alchemisten hun werk geheim om vervolging te voorkomen.
* Alchemisten waren vaak erg geheimzinnig over hun werk, omdat ze bang waren dat anderen hun geheimen zouden stelen. Alchemie was een zeer competitief vakgebied en veel alchemisten geloofden dat hun werk van grote waarde was. Als gevolg hiervan waren ze vaak erg terughoudend om hun geheimen met anderen te delen.
* Sommige alchemisten waren gewoon gek. Alchemie was vaak een proces van vallen en opstaan, en veel alchemisten hebben jaren of zelfs decennia gewerkt aan experimenten die uiteindelijk nooit iets zouden opleveren. Als gevolg hiervan werden sommige alchemisten gewoon gek. In deze gevallen kan hun geheimhouding te wijten zijn aan eenvoudige excentriciteit.
Wat de reden ook mag zijn, het feit dat alchemie in het geheim werd beoefend, droeg bij aan de mysterieuze en fascinerende reputatie ervan.