De vereniging werd in 1832 opgericht door William Huntington Russell en Alphonso Taft. Het bestaat elk jaar uit 30 studenten, die worden geselecteerd op basis van hun sociale status en academische prestaties. De leden van de vereniging staan bekend als "Bonesmen" en moeten hun lidmaatschap geheim houden.
De Skull and Bones-samenleving is van veel dingen beschuldigd, waaronder het feit dat het een sekte is, een rekruteringsgebied voor de CIA en een dekmantel voor de Illuminati. Er is geen bewijs om deze beweringen te ondersteunen, en de samenleving heeft ze herhaaldelijk ontkend.
De Skull and Bones-vereniging is een geheimzinnige organisatie, maar het is niet bekend dat deze voor wie dan ook een bedreiging vormt. De leden zijn gewoon studenten die graag tot een select gezelschap behoren.