* L'alchimie était souvent considérée comme une forme de magie. Au Moyen Âge, la magie était considérée comme une pratique hérétique et quiconque était surpris en train de la pratiquer pouvait être sévèrement puni. En conséquence, de nombreux alchimistes gardaient leur travail secret afin d’éviter d’être persécutés.
* Les alchimistes étaient souvent très secrets à propos de leur travail car ils craignaient que d'autres ne volent leurs secrets. L'alchimie était un domaine hautement compétitif et de nombreux alchimistes pensaient que leur travail était d'une grande valeur. En conséquence, ils étaient souvent très réticents à partager leurs secrets avec les autres.
* Certains alchimistes étaient tout simplement fous. L'alchimie était souvent un processus d'essais et d'erreurs, et de nombreux alchimistes ont passé des années, voire des décennies, à travailler sur des expériences qui n'aboutiraient jamais à rien. En conséquence, certains alchimistes sont tout simplement devenus fous. Dans ces cas-là, leur secret peut être dû à une simple excentricité.
Quelle qu’en soit la raison, le fait que l’alchimie était pratiquée en secret a contribué à sa réputation mystérieuse et fascinante.