* Η αλχημεία θεωρήθηκε συχνά ως μια μορφή μαγείας. Κατά τον Μεσαίωνα, η μαγεία θεωρούνταν αιρετική πρακτική και όποιος συλλαμβανόταν να την ασκεί μπορούσε να τιμωρηθεί αυστηρά. Ως αποτέλεσμα, πολλοί αλχημιστές κράτησαν το έργο τους μυστικό για να αποφύγουν τις διώξεις.
* Οι αλχημιστές ήταν συχνά πολύ μυστικοπαθείς σχετικά με τη δουλειά τους επειδή φοβούνταν ότι άλλοι θα έκλεβαν τα μυστικά τους. Η αλχημεία ήταν ένα άκρως ανταγωνιστικό πεδίο και πολλοί αλχημιστές πίστευαν ότι το έργο τους είχε μεγάλη αξία. Ως αποτέλεσμα, συχνά ήταν πολύ απρόθυμοι να μοιραστούν τα μυστικά τους με άλλους.
* Μερικοί αλχημιστές ήταν απλώς τρελοί. Η αλχημεία ήταν συχνά μια διαδικασία δοκιμής και λάθους, και πολλοί αλχημιστές πέρασαν χρόνια ή και δεκαετίες δουλεύοντας σε πειράματα που ποτέ δεν θα ισοδυναμούσαν με τίποτα. Ως αποτέλεσμα, ορισμένοι αλχημιστές έγιναν απλά τρελοί. Σε αυτές τις περιπτώσεις, η μυστικότητά τους μπορεί να οφειλόταν σε απλή εκκεντρικότητα.
Όποιος κι αν ήταν ο λόγος, το γεγονός ότι η αλχημεία ασκούνταν κρυφά συνέβαλε στη μυστηριώδη και συναρπαστική φήμη της.