Μια σκοτεινή περιοχή στον ήλιο που προκαλείται από μαγνητικές καταιγίδες ονομάζεται ηλιακή κηλίδα. Οι ηλιακές κηλίδες είναι περιοχές στην επιφάνεια του ήλιου που έχουν χαμηλότερη θερμοκρασία από τις γύρω περιοχές. Προκαλούνται από την αλληλεπίδραση του μαγνητικού πεδίου του ήλιου και του θερμού πλάσματος που συνθέτει την ατμόσφαιρα του ήλιου. Τα ισχυρά μαγνητικά πεδία στις ηλιακές κηλίδες εμποδίζουν τη ροή της θερμότητας από το εσωτερικό του ήλιου, με αποτέλεσμα να φαίνονται σκοτεινά. Οι ηλιακές κηλίδες συχνά συνοδεύονται από άλλη ηλιακή δραστηριότητα, όπως εκλάμψεις και προεξοχές.