Eine mögliche Erklärung für die Geistersichtungen ist, dass die Charles W. Morgan das einzige noch schwimmende hölzerne Walschiff ist, eine Tatsache, die Geister aus der Vergangenheit anlocken könnte. Darüber hinaus war das Schiff im Laufe seiner Geschichte in mehrere tragische Ereignisse verwickelt, darunter einen Schiffbruch, bei dem mehrere Besatzungsmitglieder ums Leben kamen. Es ist möglich, dass diese Ereignisse eine anhaltende Energie auf dem Schiff hinterlassen haben, die noch heute spürbar ist.
Was auch immer die Wahrheit sein mag, es besteht kein Zweifel daran, dass das Charles W. Morgan eine unheimliche Atmosphäre hat, die es zu einem der beliebtesten Spukziele in Mystic Seaport macht. Besucher werden oft von dem Schiff angezogen, in der Hoffnung, selbst etwas Paranormales zu erleben.