Samfundet blev grundlagt i 1832 af William Huntington Russell og Alphonso Taft. Den er sammensat af 30 elever hvert år, som udvælges på baggrund af deres sociale status og akademiske præstationer. Samfundets medlemmer er kendt som "Bonesmen" og er forpligtet til at holde deres medlemskab hemmeligt.
Skull and Bones-samfundet er blevet beskyldt for mange ting, herunder at være en kult, et rekrutteringsområde for CIA og en front for Illuminati. Der er ingen beviser til støtte for disse påstande, og samfundet har gentagne gange benægtet dem.
Skull and Bones-samfundet er en hemmelighedsfuld organisation, men den er ikke kendt for at være en trussel mod nogen. Dens medlemmer er simpelthen studerende, der nyder at være en del af en udvalgt gruppe.